2010年高能新聞
您當前的位置:首頁 > 新聞動態(tài) > 高能新聞 > 要聞 > 2010年高能新聞
CAS@home志愿計算項目成功投入正式運行
文章來源:計算中心  2010-10-22
】 【】 【

  2010年10月20日,由中國科學院高能物理研究所牽頭,中科院計算技術(shù)研究所等單位共同參與的中國科學院志愿計算項目CAS@home投入正式運行。CAS@home是國內(nèi)第一個正式投入運行的志愿計算項目,這標志著中國志愿計算進入了一個新的發(fā)展階段。

  志愿計算是通過互聯(lián)網(wǎng)讓全球的普通大眾志愿提供空閑的PC時間,參與科學計算或數(shù)據(jù)分析的一種計算方式。這種方式為解決基礎(chǔ)科學運算規(guī)模較大、計算資源需求較多的難題提供了一種行之有效的解決途徑。對于科學家而言,志愿計算意味著近乎免費且無限的計算資源;而就志愿者而言,他們可以得到一個了解科學、參與科學的機會,以促進公眾對科學的理解。

  目前,志愿計算已經(jīng)成為一種較為成熟的技術(shù),運行在主流的志愿計算平臺BOINC(Berkeley Open Infrastructure for Network Computing,伯克利開放式網(wǎng)絡(luò)計算平臺)上的世界各地的志愿計算項目已經(jīng)超過100個,數(shù)百萬的志愿者參與其中。在中國,志愿計算的發(fā)展還處于起步階段。CAS@home發(fā)起之前,幾乎全部的志愿計算項目都是由歐美科學家發(fā)起的。

  CAS@home是在CERN研究員、中國科學院外國特聘研究員Francois Grey的幫助下于2010年1月在中科院高能所啟動的。其主要目標是推動志愿計算思想在中國的發(fā)展。項目服務(wù)器于今年二月份部署完成;其后與中國科學院計算技術(shù)研究所合作,進行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)(圖1)預測應(yīng)用的部署。蛋白質(zhì)的功能是由其結(jié)構(gòu)所決定,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)測定對生物理論、醫(yī)學、制藥等領(lǐng)域意義重大。由于DNA序列測定技術(shù)的迅猛發(fā)展和實驗方法測定結(jié)構(gòu)的局限,用計算的方法來預測結(jié)構(gòu)顯得越來越重要。目前,“穿線法”(Threading)是主流的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測方法,他主要通過將未知蛋白質(zhì)序列與已知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)庫進行對比,從而對未知的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)做出預測。通常已知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)庫都非常龐大,因此對計算資源的需求量也非常大,志愿計算恰恰為其提供了一個很好的平臺。目前運行在CAS@home上的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測應(yīng)用軟件由中科院計算所卜東波等人開發(fā),依據(jù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)聯(lián)配時出現(xiàn)的short-cut現(xiàn)象提出的一種高效的結(jié)構(gòu)預測方法。

  CAS@home于2010年6月13日正式開始測試。測試之初得到了廣大中國志愿者,特別是中國分布式計算論壇(www.equn.com)上諸多志愿者的支持,志愿者用戶快速增長。2010年8月加入BOINCstats (www.boincstats.com)后,用戶數(shù)量更是經(jīng)歷了一個質(zhì)的飛躍,已達2550人。

  志愿計算特別適合于那種容易被分發(fā)到個人計算機上(高度并行計算)并且不需要大量數(shù)據(jù)輸入/輸出的任務(wù)。2008年,中國超越美國成為世界上擁有互聯(lián)網(wǎng)用過戶最多的國家。據(jù)預測,2010年底,中國的互聯(lián)網(wǎng)用戶可能將會達到4億多。盡管大部分志愿計算已在臺式計算機和筆記本上運行,但其他設(shè)備,諸如游戲機和個人掌上電腦所具備的潛能也不可小覷。這對CAS@home來說絕對是一個極好的發(fā)展契機。相信隨著CAS@home項目的不斷發(fā)展及中國科學研究者對志愿計算的深入了解,志愿計算及CAS@home項目必將迎來更加輝煌的發(fā)展。

  歡迎熱愛科學,追求科學的所有人加入并支持CAS@home!詳細信息請點擊訪問我們的網(wǎng)站http://casathome.ihep.ac.cn/ 

  

圖1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模擬圖

圖2,CAS@home項目注冊用戶數(shù)

圖3,CAS@home項目注冊主機數(shù)


附件下載:

地址:北京市918信箱 郵編:100049 電話:86-10-88235008 Email:ihep@ihep.ac.cn
中國科學院高能物理研究所 備案序號:京ICP備05002790號-1 文保網(wǎng)安備案號: 110402500050